Kezeletlen anyai hypothyreosisben ritka a terhesség, de még enyhe tünetmentes esetekben is csökken a terhesség aránya.
A göbös golyva esetén a terhesség egész ideje alatt nyomon követés szükséges. Ha a vizsgálat során rosszindulatú folyamatot igazolnak, a műtét a második trimeszterben történhet, vagy elhalasztható a szülésig. Ez nem befolyásolja az eredményeket. Természetesen a hormonpótlást műtét után kell elvégezni a megfelelő gyógyszeradag mellett.
Jó hormonellátottság hiányában a magzat fejlődése károsodik, alacsony születési súly, vetélés, méhlepény-leszakadás előfordulhat.
Ha a terhes nőről korábban ismert volt, hogy pajzsmirigy alulműködése van, és megfelelő adag gyógyszerrel állítják be, akkor a terhességnek nem lesz akadálya. Ebben az esetben a gyógyszer iránti igény jellemzően 50%-kal nő a terhesség első trimeszterében.
A pajzsmirigyhormon szintjét terhesség alatt 6-8 hetente ellenőrizni kell.